연구 결과, 최근에는 급성 거부반응의 발생률이 감소하였지만 장기 생존을 결정하는 새로운 위험요인들이 더욱 중요해진 것으로 나타났다.

첫째, 만성 항체매개 거부반응은 이식받은 신장의 기능 저하(이식신 기능 저하)와 이식 실패의 가장 중요한 원인 중 하나로 나타났다. 공여자 특이 항체가 생성되면 지속적인 면역반응이 발생하여 이식된 신장이 점차 손상된다. 

둘째, 면역억제제의 장기 사용으로 인한 부작용이 중요한 문제이다. 신독성을 유발하여 이식된 신장의 기능을 점차 저하시킬 수 있으며, 장기간 사용 시 고혈압, 당뇨병, 이상지질혈증 등의 대사질환 위험도 증가시키는 것으로 보고되었다.

셋째, 감염은 이식 후 가장 흔한 합병증으로 나타났다. 면역억제 치료로 인해 BK 바이러스,거대세포바이러스, 요로감염 등이 쉽게 발생하며, 심한 경우 이식신 기능 저하나 환자의 생명을 위협할 수 있다.

넷째, 악성종양 발생 위험도 일반인보다 높았다. 장기간 면역억제제를 사용하는 환자에서는 피부암, 림프종, 신장암 등의 발생 위험이 증가하였다.

다섯째, 장기적인 이식 성공을 위해서는 단순히 거부반응을 억제하는 것뿐만 아니라 혈압 관리, 혈당 조절, 감염 예방, 암 검진, 면역억제제 용량의 적절한 조절 등 전반적인 장기 관리가 필수적이다.